Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms