Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik4Q8BMF5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms