Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2L2Q86YR7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2L2Q86YR7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms