Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5P6

TY4A-H, Transposon Ty4-H Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 413 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YGR025W	YGR025W	303 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	HSP26	YBR072W	645 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	SSE2	YBR169C	2082 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	RDH54	YBR073W	2877 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	RVB1	YDR190C	1392 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	ARX1	YDR101C	1782 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	NAM2	YLR382C	2685 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	HNT1	YDL125C	477 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	COX4	YGL187C	468 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	RPL17B	YJL177W	555 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	PDP3	YLR455W	915 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YNL150W	YNL150W	408 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	MRPL51	YPR100W	423 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	CUE3	YGL110C	1875 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	PUF2	YPR042C	3228 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	VPS33	YLR396C	2076 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	OLE1	YGL055W	1533 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	AGA1	YNR044W	2178 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	ANR2	YKL047W	1551 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	MTL1	YGR023W	1656 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YJR098C	YJR098C	1971 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	MET12	YPL023C	1974 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	TDA2	YER071C	381 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	SLX8	YER116C	825 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YKL044W	YKL044W	321 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	MRPL31	YKL138C	396 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YPL035C	YPL035C	348 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	NSL1	YPL233W	651 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	HPA2	YPR193C	471 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	PHO87	YCR037C	2772 nt		4.86	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	DHR2	YKL078W	2208 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	PAM1	YDR251W	2493 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YGL108C	YGL108C	423 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	SAE2	YGL175C	1038 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YHL034W-A	YHL034W-A	462 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	RSM25	YIL093C	795 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YIR020C	YIR020C	303 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	REE1	YJL217W	597 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YLL044W	YLL044W	447 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	AFB1	YLR040C	675 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	BUD28	YLR062C	378 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YAR075W	YAR075W	474 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	OST2	YOR103C	393 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YOP1	YPR028W	543 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	SSH4	YKL124W	1740 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	EXO5	YBR163W	1758 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	ASI3	YNL008C	2031 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YVC1	YOR087W	2028 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YMR102C	YMR102C	2505 nt		4.85	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	NUP133	YKR082W	3474 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	VHR1	YIL056W	1923 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	RTC5	YOR118W	1704 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	NHP2	YDL208W	471 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YOS1	YER074W-A	258 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	SPI1	YER150W	447 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	DFG10	YIL049W	762 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	YPT53	YNL093W	663 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	DER1	YBR201W	636 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	POF1	YCL047C	777 nt		4.84	□□□□□ -1.63
TY4A-H	Q6Q5P6	BCK2	YER167W	2556 nt		4.84	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	STE24	YJR117W	1362 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	PER1	YCR044C	1074 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	YPD1	YDL235C	504 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	RIP1	YEL024W	648 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	YGR035C	YGR035C	351 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	MAK16	YAL025C	921 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	YJR111C	YJR111C	852 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	YKL070W	YKL070W	510 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	YAR029W	YAR029W	225 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	YGL036W	YGL036W	2730 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	SPB4	YFL002C	1821 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	ARP5	YNL059C	2268 nt		4.83	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	HAA1	YPR008W	2085 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	YDR413C	YDR413C	576 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	API2	YDR525W	330 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	MPC3	YGR243W	441 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	YHL048C-A	YHL048C-A	135 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	RPB3	YIL021W	957 nt		4.82	□□□□□ -1.64
TY4A-H	Q6Q5P6	CSE4	YKL049C	690 nt		4.82	□□□□□ -1.64

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