Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms