Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Knl1Q66JQ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms