Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms