Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms