Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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