Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam228bQ497Q6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms