Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm10Q3UTQ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms