Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uspl1Q3ULM6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uspl1Q3ULM6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms