Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf6Q3TWW8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf6Q3TWW8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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