Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms