Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms