Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah2Q06986 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms