Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2mP61082 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms