Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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