Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CratP47934 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CratP47934 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CratP47934 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CratP47934 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CratP47934 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CratP47934 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CratP47934 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CratP47934 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CratP47934 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CratP47934 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CratP47934 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CratP47934 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CratP47934 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CratP47934 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CratP47934 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CratP47934 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CratP47934 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CratP47934 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CratP47934 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CratP47934 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CratP47934 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CratP47934 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CratP47934 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms