Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5cP41230 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms