Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTNP21246 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTNP21246 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTNP21246 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTNP21246 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTNP21246 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTNP21246 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms