Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lama1P19137 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms