Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms