Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prf1P10820 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prf1P10820 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prf1P10820 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms