Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms