Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp1baO35930 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1baO35930 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms