Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabep1O35551 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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