Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf5O35326 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms