Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smad7O35253 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smad7O35253 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad7O35253 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smad7O35253 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Smad7O35253 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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