Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac1O09106 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac1O09106 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.4 ms