Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem200cJ3QK46 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms