Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20425E9Q035 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms