Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trappc8E9PWG2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms