Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brpf1B2RRD7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms