Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms