Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms