Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms