Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod3Q9R0E1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms