Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsfQ9R013 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms