Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six6Q9QZ28 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms