Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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