Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Extl1Q9JKV7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Extl1Q9JKV7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Extl1Q9JKV7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Extl1Q9JKV7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Extl1Q9JKV7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Extl1Q9JKV7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Extl1Q9JKV7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms