Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Sh3bgrlQ9JJU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Sh3bgrlQ9JJU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms