Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms