Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Subh2bvQ9D9Z7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms