Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms