Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.7 ms