Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SardhQ99LB7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SardhQ99LB7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms