Protein–RNA interactions for Protein: Q96BP2

CHCHD1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD1Q96BP2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CHCHD1Q96BP2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD1Q96BP2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms