Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Smg8Q8VE18 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Smg8Q8VE18 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Smg8Q8VE18 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Smg8Q8VE18 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Smg8Q8VE18 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Smg8Q8VE18 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Smg8Q8VE18 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smg8Q8VE18 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Smg8Q8VE18 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Smg8Q8VE18 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Smg8Q8VE18 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Smg8Q8VE18 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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